Handikapp & Habilitering samarbetar i hög utsträckning med den sjukhusanknutna habiliteringen. För barn i norra länet finns den i huvudusak på Astrid Lindgrens sjukhus, för barn i Stockholm på Sachhska barnsjukhuset och i södra länet på Barnens sjukhus i Huddinge. Den rehabiliteringsmedicinska kliniken för vuxna med funktionshinder hör organisatoriskt till Danderyds sjukhus, men är belägen i Huddinge sjukhus lokaler. Till den kliniken hör även ett team för vuxna med utvecklingsstörning.
Vi samverkar även med andra kliniker inom sjukhusen, till exempel ortopedi.
Även psykiatrin är en viktiga samverkanspartners inom landstinget, såväl barn- och ungdomspsykiatrin som vuxenpsykiatrin.
För samverkan med kommunerna finns ett samverkansavtal, den så kallade BUS-samverkan, samverkan för barn med särskilda behov.
Skolorna i Stockholms stad har tagit fram en "Hjälpreda" för att tydliggöra ansvarsgränserna och samverkan mellan skola, stat och landsting.

